连有四个不同取代基的碳原子。这是最直观、最容易上手的判据,但只是一个充分条件式的起点。
LECTURE 07 · CHAPTER 5-1
立体化学:手性、对映体与 R/S 构型
Stereochemistry: chirality, enantiomers, and the R/S configuration
1. 从平面结构式到三维结构
前几课讨论的结构式都是平面写法,但碳的四个键在空间里指向四面体的四个顶点。两个分子可以有完全相同的连接顺序、完全相同的官能团,却因为原子在空间中的排布不同而成为不同的化合物——它们甚至可能有截然相反的生物活性。立体化学(stereochemistry)就是研究分子三维结构的学科。
课件用两个对比鲜明的例子说明“空间排布不是细节”。丁烯二酸 HOOC–CH=CH–COOH 有两种几何形式:反式的富马酸(fumaric acid,反丁烯二酸)是动植物体内必需的代谢中间体;顺式的马来酸(maleic acid,顺丁烯二酸)却对组织有刺激毒害作用。两者的分子式与连接顺序完全一致,差别只在两个羧基位于双键的同侧还是异侧。
更沉重的是沙利度胺(thalidomide,反应停)。它作为手性化合物,R-构型具有抑制妊娠反应的活性,S-构型却有致畸性。二十世纪五十年代末起,该药陆续进入欧洲、日本、澳大利亚、非洲和拉丁美洲市场,到六十年代初已使 46 个国家超过一万名新生儿出现畸形,例如海豹肢症(phocomelia)。澳大利亚产科医生 William McBride 与德国儿科医生 Widukind Lenz 怀疑婴儿致畸与该药有关,1961 年由 Lenz 证实;美国 FDA 的 Frances Oldham Kelsey 则因要求补充药理研究而拒绝了上市申请。这是药物史上最著名的案例之一,成名的原因不是疗效,而是毒性。
课件给出了这个案例最关键的一层:R-构型与S-构型在体内会互相转化(消旋化)。无论服用哪一种光学纯化合物,在血清中都发现是消旋的。因此即使只给患者有效的R-构型,也无法保证没有毒性。手性药物的安全不能只靠“分离出单一对映体”来解决,还要处理体内消旋、代谢与转运带来的问题。
针对这一问题,课件列出了三条现代解决路径:不对称合成(asymmetric synthesis)、生物催化过程(biocatalytic process)与手性拆分(chiral resolution)。它们分别从“直接造出想要的那一种”“借用酶的选择性”和“造完再分开”三个角度入手。
2. 异构体的分类地图
立体化学的讨论对象是异构体中的一支。课件先给出一张完整的分类地图,把“连接方式不同”和“连接方式相同而空间取向不同”彻底分开。
构造异构体 · constitutional isomer(亦称 structural isomer)
- 碳架异构体 carbon skeleton isomer:碳骨架的分支方式不同
- 位置异构体 position isomer:官能团或取代基位置不同
- 官能团异构体 functional group isomer:官能团种类不同
- 互变异构体 tautomeric isomer:伴随质子转移的快速互变
- 价键异构体 valence bond isomer:成键方式本身不同
这张图里最需要记住的分界是能否通过旋转互相转化。构象异构体之间只靠单键旋转就能互换,能量差小、室温下往往快速互相转化;构型异构体之间的转化必须断裂并重新形成化学键,因此可以把它们分别装进不同的瓶子里。上一课讨论的 Newman 投影与丁烷能量曲线属于构象问题,本课要处理的则是构型问题。
3. 手性与对映体
课件把手性称为“自然界的基本性质”。它的理论基础来自 1874 年 LeBel 与 van’t Hoff 提出的碳原子四面体结构——正因为碳的四个键指向四面体的四个顶点,四个不同的基团才可能有两种不同的空间排布。
判断两个物体是否“相同”,标准是能否完全重叠(superimposable)。手性(chirality)的定义就建立在这个操作上:一个物体如果有左手形式和右手形式,它就是手性的;手性物体具有与自身不同的镜像。反过来,如果镜像可以通过平移与旋转和原物完全重合,该物体就是非手性的(achiral)。
把这一判据用在分子上,就得到对映体(enantiomers)的定义:互为镜像但不能完全重叠的一对立体异构体。课件用两个动作概括了区分:把两个分子“平行移动—重叠”,能重合的就不是对映体;需要“旋转 180°—重叠”的,才是同一分子的不同取向。对映体之间的唯一差别是三维取向,因此它们所有非手性环境下的物理性质都相同——这正是分离它们如此困难的原因。
课件特别注明,完全重叠是一种想象中的检验,不涉及真实的物理过程。它是判定分子是否具有手性的定义性操作,而不是实验手段。实际实验判断依靠旋光性、手性色谱、NMR 手性位移试剂等方法。
4. 手性碳、手性中心与立体中心
在实际分子中寻找手性来源时,最常用的是不对称碳原子(asymmetric carbon atom),也称手性碳原子(chiral carbon atom):连有四个不同取代基的碳原子,通常用星号(*)标出。2-溴丁烷就是最简单的例子之一,它的 C2 连有 Br、H、CH3 与 CH2CH3 四个不同基团。
两张图是同一分子的两个对映体:把虚线换成实楔线,就得到镜像。优先次序 Br > CH2CH3 > CH3 > H。
课件接着区分了三个容易混用的术语,它们的严格程度依次放宽:
IUPAC 术语,指任何所连配体在空间中的排布不能与自身镜像重叠的原子。它不限于碳,也可以是 N、P、S 等。
只要交换该原子上的两个基团就能得到立体异构体,该原子即为立体中心。范围最宽,包含不产生手性的立体中心(如某些顺反异构中心)。
这三个概念是层层包含的关系:不对称碳 → 手性中心 → 立体中心,范围依次扩大。课件给出的三条经验规则把“有手性碳”和“分子有手性”之间的关系讲清楚了:
- 没有手性碳原子的化合物,通常是非手性的。
- 只有一个手性碳原子的化合物,一定是手性的。
- 有一个以上手性碳原子的化合物,不一定是手性的——分子内可能同时存在对称因素把它抵消掉。
第一条规则里的“通常”很关键:本课后面会看到联苯、丙二烯、反式环辛烯等分子,它们完全没有手性碳原子,却仍然是手性的。也就是说,寻找手性碳是一个好用的起点,而不是唯一的判据;真正的判据始终是对称性。
5. 对称元素与手性
既然有手性碳的分子未必有手性,就需要一个更根本的判据。课件的做法是反过来找对称元素:分子只要具备某几种对称元素,就一定不是手性的。
分子内对称面 σ
能把分子切成互为实物与镜像两半的平面,称为分子的对称面(internal mirror plane),用希腊字母 σ 表示。如果分子右侧恰好是左侧的镜像,那么分子与它自己的镜像就是同一个分子。任何有对称面的分子都是非手性分子,即使它含有手性碳原子。
课件提醒“注意环状分子”。环系上的取代基很容易让人以为有手性,但对称面常常就在眼前:甲基环己烷看似有一个取代碳,却因为分子整体有对称面而非手性。作为对照,2-甲基环己酮的羰基打破了对称性,分子不再有对称面,因而是手性的。
关键不是数取代基,而是找对称面:甲基环己烷的取代碳连有两条相同的环路径,2-甲基环己酮的取代碳则连有 –H、–CH3、–CO– 与 –CH2– 四条不同路径。
对称中心 i
如果分子中存在一个点,所有通过这个点画出的直线都能以等距离到达相同的基团,该点称为对称中心(symmetric center),用 i 表示。一个分子最多只能有一个对称中心,与它对应的对称操作是“倒反”。具有对称中心的分子一定是非手性的。
反轴 Sn
分子绕某个轴旋转 2π/n 之后,再用垂直于该轴的平面进行一次反映,若所得结果与原来的分子重合,则该轴称为反轴(improper axis),记作 Sn,n 为它的级。反轴同时关联旋转与反映两种操作,具有反轴的分子不是手性分子。
反轴与前面的对称元素并不是彼此独立的。课件给出了两条对应关系:
也就是说,有对称面的分子必然有一级反轴,有对称中心的分子必然有二级反轴。把这两种情形排除后,独立剩下的只有 S4。于是得到一条实用的经验判据:
如果一个分子既没有对称面、也没有对称中心、又没有 S4 反轴,那么它基本上就是手性分子。这条判据在考试和实际判断中比“数手性碳”可靠得多,因为它直接从对称性出发。
6. 构象可动体系的手性
单键可以自由旋转,分子因此不断在多个构象之间变化。这给手性判断带来一个特殊问题:分子在某个构象下看起来是手性的,在另一个构象下却可能是非手性的,那么它到底算不算手性?
课件用顺-1,2-二溴环己烷说明这一点。它的两种椅式构象互为镜像,并且能量完全相同,因此彼此之间快速互变。任何一份样品中都必然含有等量的两种镜像构象,分子整体不表现光学活性。分子的手性构象与其镜像处于平衡时,该分子不可能有光学活性,我们把它视为非手性分子。
由此得到判断构象可动分子是否具有光学活性的操作原则:
- 考察对称程度最大的那个构象。如果分子与某个非手性结构或构象处于平衡,它不可能有光学活性。
- 手性化合物没有可达到的非手性构象。换句话说,只有当分子在所有可达构象下都保持手性时,它才是真正的手性分子。
这条原则也解释了为什么不能对着一张构象图下结论。看到 gauche 丁烷的 Newman 投影时,它确实有手性轴般的外观,但丁烷整体是非手性的——因为它可以旋转到有对称面的对位交叉构象。判断时要问的是“它能不能转过去”,而不是“它现在长什么样”。
7. 构象对映异构:手性轴与手性面
有一类分子因为体积太大或张力太高,无法从一种手性构象转到它的镜像构象。这时两种构象就成了一对可以分离的对映体,称为构象对映异构现象。课件按手性来源把它们分成三类。
含手性轴:联苯型阻转异构体
联苯两个苯环之间的单键本应自由旋转,但当四个邻位都被足够大的基团占据时,旋转受阻,分子被“锁”在一种扭曲构象中,产生可拆分的阻转异构体。课件给出了基团阻转能力的顺序:
课件还给出了一个基于键长的经验判据:当碳原子与 X1(或 X3)的中心距离、加上碳原子与 X2(或 X4)的中心距离之和大于 290 pm 时,室温以下有可能把该化合物拆分为旋光异构体。配套的 C–X 中心距离数据为:
含手性轴:丙二烯型
丙二烯(allene)型分子 CH3–CH=C=CH–CH3 中,相邻的两个双键平面互相垂直,并且不能绕中心碳扭转。当两端碳各连有两个不同基团时,分子就没有对称面也没有对称中心,两端各成为一个手性来源,整体呈手性。
环张力锁定的构象
反-环辛烯(trans-cyclooctene)因为环张力太大,无法达到对称程度最大的构象,两种手性构象之间的转化被禁止,因此可以拆分。这与顺-1,2-二溴环己烷恰好相反:后者能转,所以是非手性的;前者转不动,所以是手性的。
含手性面
分子内存在一个扭曲的面,使整个分子呈现螺旋状结构时,就产生手性面。课件举的例子是六螺苯(helicene),它有明确的左旋与右旋两种形式。
无论手性来自轴还是面,克服它的代价都是能量:要么是旋转所需跨越的位阻能垒(联苯),要么是扭转双键所需的能量(丙二烯),要么是环张力(反式环辛烯)。只要这个能垒足够高,两种构象就能分别存在,从而被拆分。
8. CIP 顺序规则
对映体的物理性质几乎完全相同,名字却必须能区分它们。课件用丙氨酸(alanine)说明问题:天然丙氨酸可以被代谢利用,非天然的则是“无用的氨基酸”,但两者在 IUPAC 命名下都叫丙氨酸或 2-氨基丙酸。必须有一套规则给它们各自一个确切的名字。
这套规则就是 Cahn–Ingold–Prelog 顺序规则(CIP sequence),它的任务是给连在手性碳上的四个基团排出先后。具体规则有四条:
- 单原子取代基:按原子序数大小排列,原子序数大的优先级高。次序为 I > Br > Cl > S > P > Si > F > O > N > 13C > 12C > B > Li > 3H > 2H > 1H。同位素之间按质量数排序,因此 13C 优先于 12C。
- 多原子取代基:第一个原子不同时按单原子规则比较;第一个原子相同时,比较与它相连的其他原子;仍然相同则沿取代链逐次向外比较。例如 –CHF2 优先于 –CHCl2(F > Cl),–CH2CH2CH3 优先于 –CH2CH3。
- 含双键或三键的基团:可认为该原子连有两个或三个相同的原子。例如 C=C 按 (C–C–C) 处理,即把双键拆成两条单键来数。
- 不足四个键的原子:用原子序数为零的假想原子补足,假想原子的优先级最低。例如在 CH3CH2NHCH3 中比较时,顺序为 –CH2CH3 > –CH3 > –H > 假想原子。
课件给出的四组排序练习全部指向 S 构型,可以用来自查是否掌握了规则:
比较第一个原子:F > N > C > H。
比较第一个原子:N > C > C > H;两个碳之间再比较所连原子,羧基碳为 (O,O,H),甲基碳为 (H,H,H)。
三个碳首层都是 (C,H,H),需要向外一层比较:异丙基有两个碳分支,另外两个只有一个;再比较 –CH2CH2Br 与 –CH2CH3,前者次层含 Br。
醛基碳按 (O,O,H) 处理,优先级最高;–CH=CH2 的双键碳按 (C,C,H) 处理,胜过异丙基的 (C,C,H) 后再比较次层。
“双键按两个单键数”这一条最容易被忽略。醛基 –CHO 之所以排在 –CH2OH 前面,正是因为它的碳连有两个氧(O,O,H),而不是一个氧(O,H,H)。如果忘记这条,整组排序都会算错。
9. R/S 构型判定的操作流程
基团顺序排好之后,就可以给手性碳标定构型。课件的操作步骤是:
- 确定四个取代基团的优先次序,依次记为 1、2、3、4,其中 1 为最高、4 为最低。
- 把次序最小的第 4 号基团置于离眼睛最远处。可以借助三维图或分子模型。
- 沿手性碳与第 4 号基团成键的方向观察分子,从 1 号基团经过 2 号指向 3 号画一个箭头。
- 如果箭头指向顺时针方向,该手性碳为 R 构型(拉丁文 rectus,“右”)。
- 如果箭头指向逆时针方向,该手性碳为 S 构型(拉丁文 sinister,“左”)。
完整的构型名称由三段拼成:构型标记(R/S,或 D/L,顺反用 Z/E)+ 取代基(位置 + 个数 + 名称)+ 母体(官能团位置 + 名称)。以丙氨酸为例,两个对映体分别命名为 (S)-丙氨酸与 (R)-丙氨酸,也就是 (S)-2-氨基丙酸与 (R)-2-氨基丙酸——这里的R/S 构型标记由 CIP 顺序规则直接推出。
优先次序 NH2 > CO2H > CH3 > H,把氢背向观察者后判断旋转方向。
课件在命名格式里把 R/S 与 D/L 并列,但它们属于两套不同的体系。R/S 由 CIP 顺序规则直接推出,与基团的相对空间排布严格对应;D/L 是以甘油醛为参照的相对构型标记,主要用于糖和氨基酸。两者没有简单的换算关系,不能互相推导。
课件用 1,3-二溴丁烷演示了完整流程。先找手性碳:C1 是 CH2Br、C4 是 CH3,都不符合条件,只有 C3 是不对称碳。再排基团顺序:Br > CH2CH2Br > CH3 > H。把 H 背向观察者后,1→2→3 呈逆时针,因此是 (S)-构型;其镜像即为 (R)-构型。课件还用香芹酮(carvone)给出了一个练习,要求找出手性碳并判断它属于 (R) 还是 (S)。
只有 C3 是不对称碳(C1 与 C4 各连两个氢)。基团顺序 Br > CH2CH2Br > CH3 > H。
手性碳是环上带异丙烯基的那个碳(C5)。两个对映体气味不同——(R) 像留兰香、(S) 像葛缕子——是“对映体只在与手性环境作用时才显出差别”的经典例子。
10. 环状与螺环化合物的构型命名
环状分子有多个手性中心时,每个中心都要单独标定构型,再按位置编号写在母体名称前面。课件以 1,3-二甲基环戊烷为例:
两个中心的构型相反,对应 cis-1,3-二甲基环戊烷(两个甲基在环同侧)。
两个中心的构型相同,对应 trans-1,3-二甲基环戊烷(两个甲基在环异侧)。
判断顺反只需看两个甲基的楔线是否同向:同为虚线(或同为实楔线)即同侧,一实一虚即异侧。三张图由 Chemical Structure Renderer 从显式 SMILES 渲染;本文另用 RDKit 做 3D 嵌入,按环平面法向量计算两个甲基的有符号距离,确认第一张同号(cis)、后两张异号(trans)。
这里有一个值得注意的对应关系:顺反标记与 R/S 标记之间并非一一独立。对 1,3-二甲基环戊烷而言,“同侧/异侧”恰好等价于“两个构型标记相同/相反”。但这个等价关系依赖于取代基的编号方式与优先级排布,不能当作通用公式套用到所有环系上。课件另外给出了螺环的例子 (S)-1-甲基螺[2.5]辛烷,说明螺环化合物的手性同样用 R/S 描述。
面对环系,先找对称面判断分子整体是否手性(第 5 节的经验判据),再对确实存在的手性中心逐个标定 R/S。反过来做容易出错:把每个带取代基的环碳都当成手性碳,会得出比实际更多的手性中心。
11. 教材对照:本讲在 Wade 第 5 章中的位置
本讲的术语体系、例题与作业题都直接来自 Wade《Organic Chemistry》第 8 版第 5 章 §5-3。课件把教材的展开压缩成了幻灯片,对照教材可以补回被省略的限定条件与记忆法。
课件大纲列出但本讲未展开的内容对应 Wade §5-4 旋光性(书页 185)、§5-6 外消旋体、§5-7 对映体过量(书页 191–192)、§5-9B 丙二烯(书页 196)、§5-10 Fischer 投影(书页 197)、§5-11 非对映体(书页 201)、§5-13 内消旋化合物(书页 205)、§5-16 拆分(书页 209),属 Chapter 5-2 范围,本页不提前展开。
12. 本课复习清单
- 说出立体化学研究什么,并用富马酸/马来酸与沙利度胺说明空间排布为什么重要。
- 解释沙利度胺案例中“体内消旋化”为什么使单一对映体给药也无效,并说出三条现代解决路径。
- 画出异构体分类地图,区分构造异构体与立体异构体,并在立体异构体下分出构型与构象两支。
- 用“完全重叠”这个操作定义手性和对映体,说明为什么“旋转 180°”与“平移”是两种不同的检验。
- 辨析手性碳、手性中心与立体中心三个术语的严格程度,并复述关于手性碳数目的三条经验规则。
- 写出对称面 σ、对称中心 i、反轴 Sn 各自如何导致分子非手性,并说明 S1、S2 分别等于什么。
- 复述手性的经验判据:没有 σ、没有 i、没有 S4 时分子基本上是手性的。
- 说明判断构象可动分子手性时为什么要“考察对称程度最大的构象”,并用顺-1,2-二溴环己烷与丁烷各举一例。
- 列举三类构象对映异构现象(联苯型、丙二烯型、环张力锁定型)与含手性面的例子,说明共同点是什么。
- 叙述 CIP 顺序规则的四条内容,并独立排出课件给出的四组基团顺序。
- 写出手性碳 R/S 判定的五个步骤,并说明为什么必须把第 4 号基团背向观察者。
- 说明 R/S 与 D/L 的区别,以及它们为什么不能互相换算。
- 给出 1,3-二溴丁烷的手性碳位置、基团顺序与最终构型,并写出它的对映体。
- 写出 1,3-二甲基环戊烷三种立体异构体的 R/S 名称与对应顺反关系。
13. 课件勘误与提示
- 本讲的章节提纲列出七个主题(Introduction、Chirality and enantiomers、Nomenclature of asymmetric carbon atoms、Fischer projections、Diastereomers、Optical activity、Resolution and asymmetric synthesis),但课件实际只推进到前三项与环状/螺环化合物的命名,共 36 页。Fischer 投影、非对映体、旋光性与拆分将在下一讲(Chapter 5-2)展开,本页不提前展开。
- 课件第 11 页的重叠检验图标注为 (a)(b) 两组,正文未说明哪一组对应手性。按图意,(a) 旋转后仍不能与镜像重合,为手性;(b) 可以重合,为非手性。
- 课件英文存在若干拼写问题:Mirror igmage 应为 mirror image,configeration 应为 configuration,archiral 应为 achiral,Nonsuperimposable chiral ? 应为 Nonsuperimposable — chiral?。本页正文已按正确拼写表述。
- 课件第 14 页把“没有手性碳原子的化合物通常是非手性的”写成一般陈述,容易与后面联苯、丙二烯、反式环辛烯的例子冲突。这三类分子都没有手性碳原子却具有手性,判断时应以对称性为准,而非以手性碳数目为准。
- 课件中对称中心一节写作“只可能有一个对称中心”,这是就单个分子而言的正确表述;不要把“一个分子最多一个对称中心”推广成“最多一个对称元素”。
- 联苯拆分判据(两侧 C–X 中心距离之和大于 290 pm)是经验规则,用于估计阻转能垒是否足以在室温下分离。课件给出的 C–X 距离为平均值,实际分子中受键角与取代基影响会有偏差,具体能否拆分仍需实验确认。
- 课件把顺反标记(Z/E、cis/trans)与构型标记(R/S、D/L)并列在同一个命名格式中。它们属于不同的描述层次:顺反描述取代基相对位置,R/S 描述手性中心的绝对构型,D/L 是以甘油醛为基准的相对构型。复习时不要把它们当成可互相推导的等价标记。
- 课件第 30 页 CIP 规则的表述为“原子序数大的为大取代基”,与同页给出的顺序表(I 在最左、H 在最右)方向一致,阅读时以顺序表为准。
- 作业为教材 Page 184 与 Page 181 的习题,本页未收录答案。